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中国社科院科技考古与文化遗产保护重点实验室下设碳十四年代学、古DNA、同位素分析、残留物分析、环境考古、人骨考古、动物考古、植物考古、木材考古、冶金考古、玉石器考古、陶瓷玻璃考古、数字考古、纺织考古、文物保护科技、文物保护修复、考古遗产、实验室考古方舱等18个子实验室，以及中华文明探源、夏商文明、“一带一路”、中华民族共同体研究、大数据与人工智能等5个科技考古联合实验室。

科技考古与文化遗产保护重点实验室综合运用生物学、分子生物学、化学、地学、物理学等学科的先进技术，组织开展跨学科、跨单位科技考古与文化遗产保护研究工作。未来5年，该重点实验室将围绕重大历史问题的科技考古与文化遗产保护持续取得进展，深化中华文明探源和夏商文明科技考古研究，推进数据库建设，对中华文明的认知不断加深，主持或主要参与国家重大项目，为国家战略服务。同时，开展世界级科技考古与文化遗产保护重大课题研究，为人类文明研究和世界文明交流互鉴贡献中国智慧与力量。

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在空间生命科学与生物技术领域，利用生命生态科学实验柜，将首次在空间站开展亚磁—微重力对果蝇基因、行为和生存繁衍的影响研究；利用生物技术实验柜，利用生物技术实验柜，开展人多能干细胞3D生长和发育潜能研究、哺乳动物胚胎着床后发育、空间辐射环境下人正常肺细胞向癌细胞转化的效应和机理、微重力环境下生物大分子液—液相分离的力学变化规律、骨组织细胞的调节作用等研究；利用应用载荷通用支持平台开展蛋白质结晶实验，以期在微重力条件下获得地面结晶困难的重要蛋白质晶体。通过这些项目，研究微重力、空间辐射、磁场等空间环境在生命活动中的作用，为人类健康及未来长期太空生存等提供理论支撑和技术探索。

在空间材料科学领域，利用无容器材料实验柜和高温材料科学实验柜开展星云物质、钨基合金等10余种金属、非金属材料的深过冷凝固及关键物性研究，开展非线性光学晶体、高性能闪烁晶体的熔体生长和凝固研究，为指导新型高性能合金设计、大尺寸高性能晶体地面制备提供技术支撑，助力精密化深紫外激光光源、土壤检测用关键材料等开发和应用；利用舱外暴露平台开展模拟月壤、空间薄膜太阳电池防护等材料的空间性能演化研究，预期成果将推动高性能太阳电池防护材料、月球基地建设材料的空间应用。

在微重力流体物理与燃烧科学领域，利用流体物理实验柜，重点围绕流体动力学及其应用、软物质非平衡动力学及先进软物质技术与应用等方面开展在轨实验，为推动空间流体管理、特殊功能软物质等相关航天技术的创新发展提供支持。利用燃烧科学实验柜，重点围绕近可燃极限和基础燃烧研究开展在轨气体燃烧实验，为发展燃烧基础理论和深入理解动力系统及相关领域燃烧的重要机理提供支持。